O Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho (IBCCF) é organizado em 7 Programas Temáticos:
Biofísica Ambiental
Coordenador de Programa: JOAO PAULO MACHADO TORRES
Vice-Coordenador de Programa: JEAN REMY DAVEE GUIMARAES
Biologia Celular e Parasitologia
Coordenador de Programa: KILDARE ROCHA DE MIRANDA
Vice-Coordenador de Programa: FABIO MENDONÇA GOMES
Biologia Molecular e Estrutural
Coordenador de Programa: EDNILDO DE ALCÂNTARA MACHADO
Vice-Coordenador de Programa: FRANCISCO MEIRELLES BASTOS DE OLIVEIRA
Fisiologia e Biofísica Celular
Coordenador de Programa: ISIS HARA TREVENZOLI
Vice-Coordenador de Programa: RAFAEL RAMOS HOSPODAR FELIPE VALVERDE GUIMARAES
Imunobiologia
Coordenador de Programa: LEONARDO HOLANDA TRAVASSOS CORREA
Vice-Coordenador de Programa: CHRISTIANNE BANDEIRA DE MELO
Medicina Regenerativa
Coordenador de Programa: FERNANDA FERREIRA CRUZ
Vice-Coordenador de Programa: LEONARDO FREIRE DE LIMA
Neurobiologia
Coordenador de Programa: JULIANA GUIMARÃES MARTINS SOARES
Vice-Coordenador de Programa: ALFRED SHOLL FRANCO